Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms