Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms