Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms