Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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