Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms