Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCOF1Q13428 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCOF1Q13428 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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