Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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