Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER4P35408 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER4P35408 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms