Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SSFA2P28290 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSFA2P28290 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSFA2P28290 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SSFA2P28290 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SSFA2P28290 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SSFA2P28290 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SSFA2P28290 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SSFA2P28290 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SSFA2P28290 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSFA2P28290 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSFA2P28290 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSFA2P28290 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSFA2P28290 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSFA2P28290 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSFA2P28290 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSFA2P28290 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSFA2P28290 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSFA2P28290 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSFA2P28290 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms