Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT1P26358 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms