Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGALS14-201ENST00000360675 773 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMLN-AS1-201ENST00000423460 542 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157702.2-201ENST00000428292 1223 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025572.1-201ENST00000472243 553 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025252.1-201ENST00000535247 556 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087894.2-201ENST00000541797 462 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02251-201ENST00000554798 1224 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC044839.1-208ENST00000634902 917 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCNT7-202ENST00000617620 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL26L1-201ENST00000265100 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA22-201ENST00000268981 1280 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms