Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms