Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms