Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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C9orf135Q5VTT2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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C9orf135Q5VTT2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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C9orf135Q5VTT2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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C9orf135Q5VTT2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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C9orf135Q5VTT2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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C9orf135Q5VTT2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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C9orf135Q5VTT2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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C9orf135Q5VTT2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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