Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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COL19A1Q14993 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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COL19A1Q14993 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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COL19A1Q14993 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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COL19A1Q14993 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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COL19A1Q14993 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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COL19A1Q14993 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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COL19A1Q14993 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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COL19A1Q14993 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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COL19A1Q14993 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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COL19A1Q14993 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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COL19A1Q14993 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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COL19A1Q14993 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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COL19A1Q14993 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL19A1Q14993 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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