Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAD4Q13485 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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