Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms