Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms