Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms