Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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