Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP290O15078 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP290O15078 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP290O15078 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP290O15078 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP290O15078 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP290O15078 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP290O15078 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP290O15078 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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CEP290O15078 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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CEP290O15078 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP290O15078 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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CEP290O15078 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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CEP290O15078 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP290O15078 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP290O15078 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP290O15078 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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CEP290O15078 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP290O15078 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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CEP290O15078 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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CEP290O15078 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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CEP290O15078 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP290O15078 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP290O15078 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP290O15078 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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