Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F8A0AVK6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms