Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RARRES3Q9UL19 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms