Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms