Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2Q9BX26 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2Q9BX26 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms