Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms