Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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NR1H3Q13133 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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NR1H3Q13133 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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NR1H3Q13133 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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NR1H3Q13133 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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NR1H3Q13133 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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NR1H3Q13133 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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NR1H3Q13133 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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