Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL16A1Q07092 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL16A1Q07092 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms