Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms