Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MCCD1P59942 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms