Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PTPRBP23467 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PTPRBP23467 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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