Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD1P0DJD0 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms