Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX7O95931 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX7O95931 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX7O95931 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX7O95931 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX7O95931 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX7O95931 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX7O95931 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms