Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim44Q9QXA7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim44Q9QXA7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms