Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AtrQ9JKK8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AtrQ9JKK8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms