Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem3Q9JKE1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trem3Q9JKE1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms