Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMURF1Q9HCE7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SMURF1Q9HCE7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMURF1Q9HCE7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms