Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms