Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sugt1Q9CX34 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sugt1Q9CX34 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sugt1Q9CX34 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sugt1Q9CX34 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sugt1Q9CX34 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sugt1Q9CX34 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sugt1Q9CX34 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sugt1Q9CX34 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sugt1Q9CX34 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sugt1Q9CX34 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sugt1Q9CX34 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sugt1Q9CX34 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sugt1Q9CX34 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sugt1Q9CX34 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sugt1Q9CX34 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sugt1Q9CX34 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sugt1Q9CX34 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sugt1Q9CX34 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms