Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIJ6

Sfpq, Splicing factor, proline- and glutamine-rich, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfpqQ8VIJ6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SfpqQ8VIJ6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SfpqQ8VIJ6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SfpqQ8VIJ6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SfpqQ8VIJ6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SfpqQ8VIJ6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SfpqQ8VIJ6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SfpqQ8VIJ6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SfpqQ8VIJ6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SfpqQ8VIJ6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SfpqQ8VIJ6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SfpqQ8VIJ6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SfpqQ8VIJ6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SfpqQ8VIJ6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SfpqQ8VIJ6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms