Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Txndc11Q8K2W3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Txndc11Q8K2W3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Txndc11Q8K2W3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms