Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkhd1l1Q80ZA4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkhd1l1Q80ZA4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkhd1l1Q80ZA4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkhd1l1Q80ZA4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkhd1l1Q80ZA4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkhd1l1Q80ZA4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkhd1l1Q80ZA4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkhd1l1Q80ZA4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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