Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF111Q6ZNA4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF111Q6ZNA4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RNF111Q6ZNA4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF111Q6ZNA4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF111Q6ZNA4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF111Q6ZNA4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF111Q6ZNA4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF111Q6ZNA4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF111Q6ZNA4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF111Q6ZNA4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF111Q6ZNA4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms