Protein–RNA interactions for Protein: Q12180

HAL9, Halotolerance protein 9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9Q12180 GCG1YER163C 699 nt6.34□□□□□ -1.39
HAL9Q12180 YLR184WYLR184W 348 nt6.34□□□□□ -1.39
HAL9Q12180 YOL050CYOL050C 321 nt6.34□□□□□ -1.39
HAL9Q12180 RPL5YPL131W 894 nt6.34□□□□□ -1.39
HAL9Q12180 PRP46YPL151C 1356 nt6.33□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 SRP101YDR292C 1866 nt6.33□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt6.33□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 PCL1YNL289W 840 nt6.33□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 YBL112CYBL112C 318 nt6.33□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 SSP2YOR242C 1116 nt6.33□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 AVT4YNL101W 2142 nt6.32□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 DIN7YDR263C 1293 nt6.32□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 TRP4YDR354W 1143 nt6.32□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 MIF2YKL089W 1650 nt6.32□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 RIX7YLL034C 2514 nt6.32□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 GTT3YEL017W 1014 nt6.31□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.31□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 NCE103YNL036W 666 nt6.31□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 PFA4YOL003C 1137 nt6.31□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 RDL1YOR285W 420 nt6.31□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 RPO26YPR187W 468 nt6.31□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 STT3YGL022W 2157 nt6.31□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 PPM2YOL141W 2088 nt6.3□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 IPI3YNL182C 1668 nt6.3□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 EMW1YNL313C 2715 nt6.3□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 RTT103YDR289C 1230 nt6.3□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 SPG1YGR236C 288 nt6.3□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 YIL086CYIL086C 309 nt6.3□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 OM45YIL136W 1182 nt6.3□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 TSR2YLR435W 618 nt6.3□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 MRPS8YMR158W 468 nt6.3□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 SEC18YBR080C 2277 nt6.29□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 PEX7YDR142C 1128 nt6.29□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 NCS6YGL211W 1080 nt6.29□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 YRB2YIL063C 984 nt6.29□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 YLR402WYLR402W 192 nt6.29□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 CUE4YML101C 354 nt6.29□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 MSS1YMR023C 1581 nt6.29□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 YMR252CYMR252C 405 nt6.29□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 PHO3YBR092C 1404 nt6.29□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 PEX31YGR004W 1389 nt6.29□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 NMT1YLR195C 1368 nt6.29□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 ERG8YMR220W 1356 nt6.29□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 GPD2YOL059W 1323 nt6.28□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 YBR284WYBR284W 2394 nt6.28□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 YHL045WYHL045W 348 nt6.28□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 YJU2YKL095W 837 nt6.28□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 DID2YKR035W-A 615 nt6.28□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 YKR045CYKR045C 552 nt6.28□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 MHT1YLL062C 975 nt6.28□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt6.28□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 VPS28YPL065W 729 nt6.28□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 YHK8YHR048W 1545 nt6.28□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 COX10YPL172C 1389 nt6.28□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 YPR204WYPR204W 3099 nt6.28□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 NOG2YNR053C 1461 nt6.28□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 HXT15YDL245C 1704 nt6.28□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 HXT16YJR158W 1704 nt6.28□□□□□ -1.4
HAL9Q12180 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 ADK2YER170W 678 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 YGL101WYGL101W 648 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 DYS1YHR068W 1164 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 DRE2YKR071C 1047 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 PML1YLR016C 615 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 SNN1YNL086W 309 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 YPL014WYPL014W 1146 nt6.27□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 TKL2YBR117C 2046 nt6.26□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 STD1YOR047C 1335 nt6.26□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.26□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 YLR198CYLR198C 360 nt6.26□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 YAR064WYAR064W 300 nt6.26□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 YNL200CYNL200C 741 nt6.26□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 YNL319WYNL319W 441 nt6.26□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 HIS1YER055C 894 nt6.25□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 MED6YHR058C 888 nt6.25□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 HRT1YOL133W 366 nt6.25□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 BNA5YLR231C 1362 nt6.25□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 SMF3YLR034C 1422 nt6.25□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 YDR161WYDR161W 1164 nt6.24□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 SAY1YGR263C 1275 nt6.24□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 ATG36YJL185C 882 nt6.24□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 IMD1YAR073W 1212 nt6.24□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt6.24□□□□□ -1.41
HAL9Q12180 RFC4YOL094C 972 nt6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms