Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnn2Q08093 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnn2Q08093 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnn2Q08093 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnn2Q08093 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnn2Q08093 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cnn2Q08093 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cnn2Q08093 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cnn2Q08093 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnn2Q08093 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnn2Q08093 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms