Protein–RNA interactions for Protein: Q03790

NUP53, Nucleoporin NUP53, yeastyeast

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP53Q03790 YJR107WYJR107W 987 nt5.52□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 NDJ1YOL104C 1059 nt5.52□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 MRPL36YBR122C 534 nt5.52□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 MNS1YJR131W 1650 nt5.52□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 NMT1YLR195C 1368 nt5.52□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 KNS1YLL019C 2214 nt5.51□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.51□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 FPR2YDR519W 408 nt5.51□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt5.51□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 KTR1YOR099W 1182 nt5.51□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 YPL102CYPL102C 303 nt5.51□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 SMK1YPR054W 1167 nt5.51□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 ADE12YNL220W 1302 nt5.5□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 YDR509WYDR509W 348 nt5.5□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 LEU5YHR002W 1074 nt5.5□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 POP5YAL033W 522 nt5.5□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 MTC2YKL098W 1074 nt5.5□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 YLR312CYLR312C 1197 nt5.5□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 MRPS16YPL013C 366 nt5.5□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 RPL5YPL131W 894 nt5.5□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 YPR150WYPR150W 522 nt5.5□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 VPS72YDR485C 2388 nt5.5□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 PRI2YKL045W 1587 nt5.5□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 GLN3YER040W 2193 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 UGX2YDL169C 672 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 QCR8YJL166W 285 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 YLR123CYLR123C 330 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 YMC1YPR058W 924 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 ATG7YHR171W 1893 nt5.49□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 EXG1YLR300W 1347 nt5.48□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 ISN1YOR155C 1353 nt5.48□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.48□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 DFM1YDR411C 1026 nt5.48□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 TAF4YMR005W 1167 nt5.48□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 GEF1YJR040W 2340 nt5.48□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 SLX5YDL013W 1860 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 AVT4YNL101W 2142 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 GTT3YEL017W 1014 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 SPO7YAL009W 780 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 MRPS5YBR251W 924 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 PYC2YBR218C 3543 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 APM4YOL062C 1476 nt5.46□□□□□ -1.53
NUP53Q03790 UTP4YDR324C 2331 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 COS6YGR295C 1146 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 DYS1YHR068W 1164 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 IES2YNL215W 963 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 YNL247WYNL247W 2304 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 POP1YNL221C 2628 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 BPL1YDL141W 2073 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 CDC34YDR054C 888 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 YEL068CYEL068C 333 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 SNO4YMR322C 714 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 RRS1YOR294W 612 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 HSP33YOR391C 714 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 HSP32YPL280W 714 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 EFT2YDR385W 2529 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 EFT1YOR133W 2529 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 CNM67YNL225C 1746 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 CBP4YGR174C 513 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 MDM31YHR194W 1740 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 OPI8YKR035C 642 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 MSS1YMR023C 1581 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 CWC25YNL245C 540 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 CTR1YPR124W 1221 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 NHA1YLR138W 2958 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 HXK2YGL253W 1461 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 CDC19YAL038W 1503 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 BNA5YLR231C 1362 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 YCR099CYCR099C 468 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 RRP1YDR087C 837 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 RPN11YFR004W 921 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 JJJ3YJR097W 519 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 CBT1YKL208W 816 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 TSA1YML028W 591 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 MRPS12YNR036C 462 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 MRI1YPR118W 1236 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 RPO26YPR187W 468 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 HXT17YNR072W 1695 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 GAT1YFL021W 1533 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 PXL1YKR090W 2121 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 UTR2YEL040W 1404 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 PET112YBL080C 1626 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 YDL119CYDL119C 924 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 MMS21YEL019C 804 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 YER147C-AYER147C-A 411 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 LYS12YIL094C 1116 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 RPE1YJL121C 717 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 RPL10YLR075W 666 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 WHI2YOR043W 1461 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 EMW1YNL313C 2715 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 ARO10YDR380W 1908 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 AIM17YHL021C 1398 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 YCK1YHR135C 1617 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 BRL1YHR036W 1416 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 NCS6YGL211W 1080 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 YGR127WYGR127W 939 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 YJU2YKL095W 837 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 YNL234WYNL234W 1281 nt5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 1095.8 ms