Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tgfb3P17125 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgfb3P17125 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgfb3P17125 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms