Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CrcpO35427 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CrcpO35427 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CrcpO35427 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CrcpO35427 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CrcpO35427 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CrcpO35427 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CrcpO35427 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CrcpO35427 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CrcpO35427 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CrcpO35427 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CrcpO35427 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CrcpO35427 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CrcpO35427 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CrcpO35427 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CrcpO35427 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms