Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r67G5E8C1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms