Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20538F6Z9R1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms